Secara administratif, Desa Karyamukti dibagi menjadi 4 dusun, yaitu Dusun Pabuaran, Dusun Karanganyar, Dusun Karangtanjung, dan Dusun Pasirgintung. Desa ini juga memiliki 10 Rukun Warga (RW) dan 38 Rukun Tetangga (RT), yang mendukung struktur organisasi desa dan memudahkan pengelolaan serta pelayanan kepada masyarakat.

Desa Karyamukti terletak pada ketinggian sekitar 270 meter di atas permukaan laut (mdpl), memberikan karakter geografis yang khas untuk desa ini. Sejak berdiri, desa ini telah dipimpin oleh lima kepala desa definitif dan tiga Penjabat (Pj) Kepala Desa. Kepala Desa pertama adalah M. Nardhi, diikuti oleh H. Encud Sudria sebagai kepala desa kedua. Periode kepemimpinan berikutnya diisi oleh Yati Sri N (kepala desa ketiga) dan Sudaryat Chandra (kepala desa keempat). Saat ini, kepala desa yang menjabat adalah Andry Suwandi, yang merupakan kepala desa kelima.

Selama perjalanan sejarahnya, Desa Karyamukti juga telah dipimpin oleh tiga Pj Kepala Desa, yaitu Ewo Raswa, Sugianta, dan Sariman, yang masing-masing berperan penting dalam masa transisi dan pengelolaan desa.

Dengan latar belakang sejarah dan kepemimpinan yang beragam, Desa Karyamukti terus berupaya untuk mengembangkan potensi lokalnya dan memberikan pelayanan terbaik bagi masyarakatnya, sambil menjaga kekayaan budaya dan kekhasan wilayahnya.